[FredBezies]

Salut.

Une simple question : il faut compter combien de temps pour traiter un paquet de données avec Genome ?

J'ai un Xp1800+ 512 Mo.

Et aussi peut-être interrompre le calcul pour le reprendre un peu plus tard ?

Merci

NB : pas eu le courage de lire les 24 pages du gros fil :-\

Désolé :cry:

[Cougar]

Tout d'abord :
Quand tu as éxécuté FAhconsole.exe tu as bien vérifier d'avoir choisie de faire du gah ? (dans le client.cfg il faut que tu aies ceci [clienttype]type=2 )

Sinon avec ta config, tu devrais mettre grossomodo de 30mn à 1h pour traiter une séquence ( ça dépend de la longueur de la chaîne en fait ).
Pour une chainlength = 100 je met environ 17h pour faire les 30 séquences

Sinon les calculs fonctionnent par séquences, donc si tu arrêtes le programme à 90% d'une séquence, tu perds tout le travail de la séquence...donc vaut mieux arrêter au commencement d'une nouvelle séquence

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
Tout d'abord :
Quand tu as éxécuté FAhconsole.exe tu as bien vérifier d'avoir choisie de faire du gah ? (dans le client.cfg il faut que tu aies ceci [clienttype]type=2 )

Pas de client type dans mon client.cfg

Le client linux doit êre par défaut en gah.

Sinon avec ta config, tu devrais mettre grossomodo de 30mn à 1h pour traiter une séquence ( ça dépend de la longueur de la chaîne en fait ).
Pour une chainlength = 100 je met environ 17h pour faire les 30 séquences

Trop long pour ma machine en utilisation quotidienne.

Sinon les calculs fonctionnent par séquences, donc si tu arrêtes le programme à 90% d'une séquence, tu perds tout le travail de la séquence...donc vaut mieux arrêter au commencement d'une nouvelle séquence

Dans ce cas, je ne vais pas participer au projet.

Pas que je n'en ai pas envie, mais le logiciel manque de souplesse, et surtout, j'ai ma machine à moins de 2 mettre de mon lit.

Et comme j'aime à dormir la nuit.... ;-]

Merci pour tes réponses.

[Cougar]

t'as ptet pas compris ce que je voulais dire
chaque calcul est composé de 30 séquences, si tu coupes à la séquence n°20, elle ne sera pas conservée, mais quand tu reprendras le calcul, tu repartiras de la séquence n°20

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
t'as ptet pas compris ce que je voulais dire
chaque calcul est composé de 30 séquences, si tu coupes à la séquence n°20, elle ne sera pas conservée, mais quand tu reprendras le calcul, tu repartiras de la séquence n°20

Je t'ai parfaitement compris. Mais disons que la séquence 1 soit terminée. Que je coupe le calcul. Est-ce qu'elle sera conservée ou pas ?

Si oui, cela m'arrangerait sinon, je ne m'impliquerais pas plus dans le projet.

[FredBezies]

Chaque séquence, c'est celle qui se divise par tranche de 10% ?

[Cougar]

euh une séquence c'est ça :

[16:57:46] [SPG] Designing protein sequence  5 of 30                   
[16:59:30] [SPG]  10.0 
[17:01:20] [SPG]  20.0 
[17:03:05] [SPG]  30.0 
[17:04:47] [SPG]  40.0 
[17:06:16] [SPG]  50.0 
[17:07:47] [SPG]  60.0 
[17:09:26] [SPG]  70.0 
[17:10:53] [SPG]  80.0 
[17:12:13] [SPG]  90.0 
[17:13:38] [SPG] 100.0 
[17:13:38] [SPG] Writing current.xyz                                   
[17:13:38] [SPG] sequence  5 completed:                                
[17:13:38] RLVVFLYYWDASGYYTLTGVPGEKLYVITFTASKLWMYVVIPRGTGWVPS . . .    
[17:13:39] Iterations: 100 of 600
[17:13:40] Finished

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
euh une séquence c'est ça :
<séquence>

Merci j'avais un doute et comme je débute avec g@h...

[Cougar]

y a pas de mal
donc t'es des nôtres ?

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
y a pas de mal
donc t'es des nôtres ?

Pour tout te dire, j'avais participé il y a 18 mois à Seti@Home qui m'a réécrit récemment.

J'avais à l'époque cumulé 114 paquet pour 2500 heures de calculs.

J'ai décidé de m'y remettre, et j'ai ajouté g@h.

Normalement, mon pseudo doit être dans la liste.

Avec un peu de chance, j'enverrais les premier résultats d'ici vendredi.

Et pour l'équipe, j'ai choisi celle de NDFR.

[Cougar]

moi 373 pour 2700h,mais j'ai tout sacrifié pour genome, ça rendra plus service à l'humanité dans l'immédiat

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
moi 373 pour 2700h,mais j'ai tout sacrifié pour genome, ça rendra plus service à l'humanité dans l'immédiat

Ouais, mais Seti est plus rapide en traitement et plus souple :-]

Et cela fait un joli économiseur d'écran ;-]

Je ne suis pas encore sur la liste de l'équipe. Car à ce que j'ai compris, il faut entrer l'identifiant commençant par 70-----, non ?

J'ai quand même poussé un peu le bouchon, car j'ai activé le bavardage au maximum, ainsi que les optimisations assembleurs (support sse/3dnow!).

Peut-être que je gagnerais 1 seconde par séquence de calculs ;-]

[Cougar]

faut envoyer un résultat pour être "inscrit" dans l'équipe

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
faut envoyer un résultat pour être "inscrit" dans l'équipe

Je m'en doutais un peu.

Merci pour la confirmation.

A dans quelques jours, donc.

Putain de séquence qui mets 35 minutes pour calculer 10%.

Comment cela, c'est à cause de la recompilation de Mozilla ? ;-]

[Cougar]

si y a Seti qui tourne en même temps, c'est nomal