S'il est en NTFS, il se peut que le fdisk ne se comporte pas correctement (ne supprime pas les partitions par exemple).
J'ai déjà eu ce phénomène plusieurs fois
De toute façon, fdisk ne fait que modifier "l'index", pas formatter les partitions...
C'est d'ailleurs pour ça qu'après un fdisk sans formatage et le lancement du setup de Win98 ou XP (je sais plus lequel), les fichiers sont de nouveaux présents