Je doute qu'iTunes aie ce comportement d'effacer quand il ne connaît pas. A vrai dire je suis sûr que non.
Sinon, si tu cherches une alternative à iTunes, ma première suggestion c'est quand même de lire (survoler suffit) l'article. Et si ton temps est trop précieux pour ça,
yamipod devrait faire l'affaire.