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Je pense que c'est pas pour des raisons thermiques, puisque les cartes sont dans ce sens depuis la lointaine époque de l'introduction du port PCI, époque où la chaleur dégagée n'était un problème ni pour le CPU, ni pour la carte graphique.
Je vois deux raisons qui pourraient expliquer ce retournement des cartes avec l'introduction du PCI :
1) Limiter les dépôts de poussière côté composants
2) Permettre d'avoir sur une carte mère des ports partagés ISA/PCI (un seul braquet à l'arrière du boîtier pouvait accueilir soit une carte ISA, soit une carte PCI, les deux connecteurs étant placés côte à côte sur la carte mère).
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