Quel est le type d'installateur ? Parce que pour faire ca, la décompilation, c'est vraiment over-bourrin ... mieux vaut refaire l'installateur, tu perdra moins de temps
Sinon, tu peux tenter Appdeploy pour essayer de faire une install unattend :
http://www.appdeploy.com/
C'est quoi comme logiciel exactement ?