Pour la première question, je ne connais que des logiciels de synchronisation manuelle (exemple, total commander), mais il pourrait être possible de rajouter un script permettant d'automatiser cette synchronisation de répertoires.
Pour la seconde question, le CD ou DVD est plus sécurisé car :
- il ne crame pas lors d'un orage ou d'une explosion de l'alimentation, contrairement à un HD interne ou externe connecté qui risque de l'être
- les fichiers qui y sont gravés ne risquent pas d'être détruits par des virus ou d'être effacés par accident
L'avantage d'un HD externe est évidement sa capacité à stocker des quantités importantes de données (tu te vois graver plusieurs CD-RW ou DVD-RW à chaque sauvegarde ??? :confused

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A toi de voir.