Si ça n'a lieu uniquement à l'ouverture de Windows à l'invite des sessions, ce n'est pas inquiétant.
A ce moment là Windows charge plusieurs programmes et services dont certains peuvent ramer à chercher leurs informations et donc faire bosser un maximum le disque dur.
Pour en avoir le coeur net, tu peux toujours essayer de défragmenter ton disque dur (avec PerfectDisk par exemple
)