bah ils en parlent dans le film au tout début
"la dernière transmition du vaisseau osiris nous a appris que les machines étaient entrain de creuser"
donc ça se passe AVANT matrix reloaded, mais après Matrix1
et c'est le premier épisode du DVD Animatrix.
t'as juste à comprendre que y a un vaisseau qui "par hasard" elle allé à la surface et a aperçut ce que les machines faisaient, donc pour prévenir Zion, ils ont laissé un message dans la Matrice (moyen le plus discret et rapide pour communiquer on dirait
).