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Genome et temps de traitement...
Salut.
Une simple question : il faut compter combien de temps pour traiter un paquet de données avec Genome ? J'ai un Xp1800+ 512 Mo. Et aussi peut-être interrompre le calcul pour le reprendre un peu plus tard ? Merci ;-) NB : pas eu le courage de lire les 24 pages du gros fil :-\ Désolé :cry: |
Tout d'abord :
Quand tu as éxécuté FAhconsole.exe tu as bien vérifier d'avoir choisie de faire du gah ? :) (dans le client.cfg il faut que tu aies ceci [clienttype]type=2 ) Sinon avec ta config, tu devrais mettre grossomodo de 30mn à 1h pour traiter une séquence ( ça dépend de la longueur de la chaîne en fait ). Pour une chainlength = 100 je met environ 17h pour faire les 30 séquences :) Sinon les calculs fonctionnent par séquences, donc si tu arrêtes le programme à 90% d'une séquence, tu perds tout le travail de la séquence...donc vaut mieux arrêter au commencement d'une nouvelle séquence :) |
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Pas de client type dans mon client.cfg Le client linux doit êre par défaut en gah. Quote:
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Pas que je n'en ai pas envie, mais le logiciel manque de souplesse, et surtout, j'ai ma machine à moins de 2 mettre de mon lit. Et comme j'aime à dormir la nuit.... ;-] Merci pour tes réponses. |
t'as ptet pas compris ce que je voulais dire :)
chaque calcul est composé de 30 séquences, si tu coupes à la séquence n°20, elle ne sera pas conservée, mais quand tu reprendras le calcul, tu repartiras de la séquence n°20 :) |
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Si oui, cela m'arrangerait sinon, je ne m'impliquerais pas plus dans le projet. |
Chaque séquence, c'est celle qui se divise par tranche de 10% ?
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euh une séquence c'est ça :
Code:
[16:57:46] [SPG] Designing protein sequence 5 of 30 |
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y a pas de mal ;)
donc t'es des nôtres ? :) |
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J'avais à l'époque cumulé 114 paquet pour 2500 heures de calculs. J'ai décidé de m'y remettre, et j'ai ajouté g@h. Normalement, mon pseudo doit être dans la liste. Avec un peu de chance, j'enverrais les premier résultats d'ici vendredi. Et pour l'équipe, j'ai choisi celle de NDFR. |
moi 373 pour 2700h,mais j'ai tout sacrifié pour genome, ça rendra plus service à l'humanité dans l'immédiat :)
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Et cela fait un joli économiseur d'écran ;-] Je ne suis pas encore sur la liste de l'équipe. Car à ce que j'ai compris, il faut entrer l'identifiant commençant par 70-----, non ? J'ai quand même poussé un peu le bouchon, car j'ai activé le bavardage au maximum, ainsi que les optimisations assembleurs (support sse/3dnow!). Peut-être que je gagnerais 1 seconde par séquence de calculs ;-] |
faut envoyer un résultat pour être "inscrit" dans l'équipe :)
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Merci pour la confirmation. A dans quelques jours, donc. Putain de séquence qui mets 35 minutes pour calculer 10%. Comment cela, c'est à cause de la recompilation de Mozilla ? ;-] |
si y a Seti qui tourne en même temps, c'est nomal :)
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