CopyTrans Manager permet de se passer d'iTunes pour bon nombre de fonctions liées à la gestion de multimédia (musique, podcasts, vidéos...) des iPhones et iPod :
- ajout et suppression de fichiers par un simple glisser-déposer depuis l'explorateur Windows,
- création, édition et suppression de playlists,
- import des illustrations d'albums,
- édition des tags des fichiers (y compris la pochette),
- recherche sur de nombreux critères (titre, artiste, album, genre, etc...),
- lire les fichiers depuis l'appareil mobile.

Pour les iPod dont l'espace de stockage est accessible par USB Mass Storage (tous les iPod sauf les iPod Touch), il est même possible de copier et d'exécuter CopyTrans Manager directement sur l'iPod, pour l'emmener partout avec vous.