Pour en revenir au film, un [gros] détail qui m'échappe encore, et qui se situe à la frontière entre le 2 et le 3 : lorsqu'à la fin de Reloaded, Neo et l'autre bonhomme sont amené au vaisseau pour soins médicaux, après que Neo ait arrêté dans le monde réel les sentinelles et que l'EMP ait été déclanché, Neo se retrouve dans la matrice. Enfin, pas exactement, dans la gare ... dont on ne sait pas grand chose sinon qu'elle sert de cachot au mérovingien et que Neo y est enfermé.
Pour ce qui est du pouvoir de Neo sur les machines dans le monde réel, celà pourrait s'expliquer par une sorte de dualité : les hommes ont créé et donc controllé les machines, qui elles même contrôlent les hommes. Il est donc plausible qu'une telle interaction soit mutuelle : par la matrice, les machine ont le contrôle sur les hommes, mais hors de la matrice les hommes ont un certain contrôle sur les machine. De même que la matrice inclut l'Elu, les machines peuvent avoir été programmée pour le respecter dans le monde réel, et Neo a pu se voir "modifié" par les machines lors de son élevage, représentant ainsi une espèce de "fusible" pour tout le système.
Ceci dit, il reste l'histoire du train. Pourquoi Neo est-il réintégré à la matrice sans connexion physique à cette dernière, et comment peut-il alors en sortir ? Est-ce que cette éventuelle "modification" par les machines lui permettent également d'être réintégré à la matrice quand elles le souhaitent ? Pourquoi l'agent Smith n'est-il pas lui aussi prisonnier de la matrice, puisqu'enfin il a dû subir la même chose que Neo ? Et pourquoi certains "sous programmes" comme la gare peuvent-il l'asservir alors qu'il a tout pouvoir sur le système ?
C'est surtout cette fin en queue de poisson qui a porté atteinte au deuxième volet, et qui handicape franchement le début du troisième et dernier épisode. Si vous avez quelques réponses
