L'astuce est de ne pas essayer de faire en sorte que Thunderbird détecte quels sont les mails qui étaient dans le dossier indésirable de Hotmail car c'est impossible mais plutôt de laisser Thunderbird lui même traquer les mails indésirables.
Pour cela, il suffit de cliquer sur le compte où l'on souhaite appliquer le filtre dans l'arborescence à gauche, de cliquer sur Options -> Gestionnaire des indésirables... et de cocher la case "Déplacer les messages entrant identifiés comme indésirable vers" puis enfin de choisir le dossier où vous souhaitez les déplacer.
Le tour est joué !
