Genome et temps de traitement...

[FredBezies]

Salut.

Une simple question : il faut compter combien de temps pour traiter un paquet de données avec Genome ?

J'ai un Xp1800+ 512 Mo.

Et aussi peut-être interrompre le calcul pour le reprendre un peu plus tard ?

Merci ;-)

NB : pas eu le courage de lire les 24 pages du gros fil :-\

Désolé :cry:

[Cougar]

Tout d'abord :
Quand tu as éxécuté FAhconsole.exe tu as bien vérifier d'avoir choisie de faire du gah ? :) (dans le client.cfg il faut que tu aies ceci [clienttype]type=2 )

Sinon avec ta config, tu devrais mettre grossomodo de 30mn à 1h pour traiter une séquence ( ça dépend de la longueur de la chaîne en fait ).
Pour une chainlength = 100 je met environ 17h pour faire les 30 séquences :)

Sinon les calculs fonctionnent par séquences, donc si tu arrêtes le programme à 90% d'une séquence, tu perds tout le travail de la séquence...donc vaut mieux arrêter au commencement d'une nouvelle séquence :)

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
Tout d'abord :
Quand tu as éxécuté FAhconsole.exe tu as bien vérifier d'avoir choisie de faire du gah ? :) (dans le client.cfg il faut que tu aies ceci [clienttype]type=2 )


Pas de client type dans mon client.cfg

Le client linux doit êre par défaut en gah.


Sinon avec ta config, tu devrais mettre grossomodo de 30mn à 1h pour traiter une séquence ( ça dépend de la longueur de la chaîne en fait ).
Pour une chainlength = 100 je met environ 17h pour faire les 30 séquences :)


Trop long pour ma machine en utilisation quotidienne.


Sinon les calculs fonctionnent par séquences, donc si tu arrêtes le programme à 90% d'une séquence, tu perds tout le travail de la séquence...donc vaut mieux arrêter au commencement d'une nouvelle séquence :)

Dans ce cas, je ne vais pas participer au projet.

Pas que je n'en ai pas envie, mais le logiciel manque de souplesse, et surtout, j'ai ma machine à moins de 2 mettre de mon lit.

Et comme j'aime à dormir la nuit.... ;-]

Merci pour tes réponses.

[Cougar]

t'as ptet pas compris ce que je voulais dire :)
chaque calcul est composé de 30 séquences, si tu coupes à la séquence n°20, elle ne sera pas conservée, mais quand tu reprendras le calcul, tu repartiras de la séquence n°20 :)

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
t'as ptet pas compris ce que je voulais dire :)
chaque calcul est composé de 30 séquences, si tu coupes à la séquence n°20, elle ne sera pas conservée, mais quand tu reprendras le calcul, tu repartiras de la séquence n°20 :)

Je t'ai parfaitement compris. Mais disons que la séquence 1 soit terminée. Que je coupe le calcul. Est-ce qu'elle sera conservée ou pas ?

Si oui, cela m'arrangerait sinon, je ne m'impliquerais pas plus dans le projet.

[FredBezies]

Chaque séquence, c'est celle qui se divise par tranche de 10% ?

[Cougar]

euh une séquence c'est ça :

[16:57:46] [SPG] Designing protein sequence 5 of 30
[16:59:30] [SPG] 10.0
[17:01:20] [SPG] 20.0
[17:03:05] [SPG] 30.0
[17:04:47] [SPG] 40.0
[17:06:16] [SPG] 50.0
[17:07:47] [SPG] 60.0
[17:09:26] [SPG] 70.0
[17:10:53] [SPG] 80.0
[17:12:13] [SPG] 90.0
[17:13:38] [SPG] 100.0
[17:13:38] [SPG] Writing current.xyz
[17:13:38] [SPG] sequence 5 completed:
[17:13:38] RLVVFLYYWDASGYYTLTGVPGEKLYVITFTASKLWMYVVIPRGTGWVPS . . .
[17:13:39] Iterations: 100 of 600
[17:13:40] Finished

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
euh une séquence c'est ça :
<séquence>


Merci j'avais un doute et comme je débute avec g@h... ;-)

[Cougar]

y a pas de mal ;)
donc t'es des nôtres ? :)

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
y a pas de mal ;)
donc t'es des nôtres ? :)

Pour tout te dire, j'avais participé il y a 18 mois à Seti@Home qui m'a réécrit récemment.

J'avais à l'époque cumulé 114 paquet pour 2500 heures de calculs.

J'ai décidé de m'y remettre, et j'ai ajouté g@h.

Normalement, mon pseudo doit être dans la liste.

Avec un peu de chance, j'enverrais les premier résultats d'ici vendredi.

Et pour l'équipe, j'ai choisi celle de NDFR.

[Cougar]

moi 373 pour 2700h,mais j'ai tout sacrifié pour genome, ça rendra plus service à l'humanité dans l'immédiat :)

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
moi 373 pour 2700h,mais j'ai tout sacrifié pour genome, ça rendra plus service à l'humanité dans l'immédiat :)

Ouais, mais Seti est plus rapide en traitement et plus souple :-]

Et cela fait un joli économiseur d'écran ;-]

Je ne suis pas encore sur la liste de l'équipe. Car à ce que j'ai compris, il faut entrer l'identifiant commençant par 70-----, non ?

J'ai quand même poussé un peu le bouchon, car j'ai activé le bavardage au maximum, ainsi que les optimisations assembleurs (support sse/3dnow!).

Peut-être que je gagnerais 1 seconde par séquence de calculs ;-]

[Cougar]

faut envoyer un résultat pour être "inscrit" dans l'équipe :)

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
faut envoyer un résultat pour être "inscrit" dans l'équipe :)

Je m'en doutais un peu.

Merci pour la confirmation.

A dans quelques jours, donc.

Putain de séquence qui mets 35 minutes pour calculer 10%.

Comment cela, c'est à cause de la recompilation de Mozilla ? ;-]

[Cougar]

si y a Seti qui tourne en même temps, c'est nomal :)

[FredBezies]

Provient du message de Cougar
si y a Seti qui tourne en même temps, c'est nomal :)

Non, il ne tourne pas en même temps.

Mais une compilation peut bouffer jusqu'à 35% de la puissance de calcul.

Et pour être sur que la tache setiathome avait été bien evacuée de la mémoire, j'ai employé la commande kivaibien : kill -9 :-)

[FredBezies]

Le client est vraiment merdique : j'ai arrêté le calcul après deux séquences complètes. Je l'ai relancé : les deux séquences ont été perdues !

Quelle merde :-/

[Cougar]

pas trop logique ça, jvois pas quoi te dire
si t'as le fichier de log, copie/colle le ici :)

[FredBezies]

C'est simple ; j'en étais à "iterations 40 of 600".

Au redémarrage : "iterations 0 of 600" :-(

Il est reparti depuis 3 h 30 et il attaque la 4ième séquence.

Rien compris :-|