View Full Version : Venez Genomiser avec nous !
Werner
4 avril 2003, 14h06
Bah je viens de le faire :
New team NewdimensionFR with number 31922 (http://folding.stanford.edu/cgi-bin/teampage?q=31922) has been founded by FORMATMAN
Voilou donc ceux qui veulent faire du Folding@Home vous pouvez...
highlander
4 avril 2003, 14h22
C'est dommage que l'on puisse pas utiliser les 2 N° en même temps (en alternant bien sur mais dans le même client), lorsque l'on utilise le client F@H en mode G@H/F@H
Peut-être que si on a une bécane BI-CPU, c'est peut-être possible ?
Moi j'en sais rien et ce n'est pas mon cas mais les autres aimeraientt peut-être savoir ! :)
nonoghost
4 avril 2003, 15h26
Non hélas, (bis)
Pour le F@H comme le G@H, on ne le peut lancer qu'une seule fois. La deuxieme image, en voyant deja la premiere chargée en mémoire, s'arrete de suite.
par contre on peut lancer le client G@H 0.99 et le F@H 3.24 ensemble... mais bonjour la conso de temps CPU (meme pour un bi-proc ;)
Werner
4 avril 2003, 15h46
Pour les Bi-CPU, Quadri-CPU il faut lancer autant de clients installés dans autant de répertoires qu'on a de processeur. C'est la même chose pour les mono CPU PIV HyperTreading j'en lance deux ce qui me fait environ 4 résultats par jour (soit + de 100 WU). Chaque client travaille dans son propre répertoire (c'est écrit dans la FAQ de Stanford).
En gros ça donnera ça :
- 1 Celeron = 1 client
- 1 Duron = 1 client
- 1 PIV = 1 client
- 1 PIV HT = 2 clients
- 1 Athlon XP = 1 client
- 2 Athlon MP = 2 clients
- 1 PIII = 1 client
- 2 PIII = 2 clients
- 2 PIV Xeon DP = 4 clients
- 4 PIV Xeon MP = 8 clients
highlander
4 avril 2003, 15h53
Et bien là je comprend mieux pourquoi tu va aussi vite
:p
nonoghost
4 avril 2003, 20h03
Bien cela fonctionne pour le G@H mais pas pour le F@H....
Dommage...
par contre ce que j'aime bien, c'est:
1 Celeron = 1 client ....
.... 1 PIV = 1 client
C'est vrai qu'un PIV et un Celeron ont les memes perfs.... ;)
Bon, d'accord je blague !!!! :lick:
Werner
4 avril 2003, 21h10
Pour Folding@Home c'est le même principe il faut juste changer l'ID dans chaque répertoire ^^
nonoghost
4 avril 2003, 22h20
oui, UNIQUEMENT avec le client en mode console mais pas celui avec la version GUI... ;)
C'est parti.... de + belle !!!! :)
Werner
4 avril 2003, 22h59
Bah il faut utiliser le client en mode console alors ^^ je vais quand même tester car ça m'étonne.
Raaaa ça ne marche pas c'est vraiment naze...
highlander
5 avril 2003, 00h30
J'avais, au début que je Génomisais, essayé le GUI et même le screensaver et ça me faisait râmer à mort ma bécane.
C'est sûr, c'est beau des gènes dont on comprend que dale et qui bouge dans tous les sens.
Mais s'il faut que ça bloque tous, moi je préfère la bonne vieille console (pas si vieille que ça d'ailleurs :p ) même s'il n'y a pas d'animation, pourvue que cela fasse avancer la science (pas en mal j'espère, sinon j'arrête tous de suite)
nonoghost
5 avril 2003, 10h09
Provient du message de Formatman
Bah il faut utiliser le client en mode console alors ^^ je vais quand même tester car ça m'étonne.
Raaaa ça ne marche pas c'est vraiment naze...
Voui, c'est vrai... :D
Werner
10 avril 2003, 23h19
Le premier message est mis à jour !
Vivement une version du type -nonet :( Je viens de migrer quelques machines et c'est bcp plus long à calculer ce qui fait que les machines un peu anciennes vont être moins productives...
Je me joins à l'équipe avec un p4 1,9Ghz pour le moment.
Un p4 2,4Ghz va me rejoindre prochainement.
Je me suis enregistré sous le pseudo stan38, mais je ne suis pas sûr que l'enregistrement ait passé... à confirmer
streets
15 avril 2003, 23h26
bienvenu Stan, tu le saura je crois une foit un genome de crée
c a dire apres les 30 sequances de calculées et le resutat envoyé.
Sinon prochainement 2 PC vont po tourner pendant 3 semaines
pour cause de vacances forcées :D
matt-fly
16 avril 2003, 05h14
Suite à l'annonce hier à propos d Genome humain, j'ai arrêté 3 des 4 box. Je vais me renseigner si à ce stade, ça vaut encore le coup de faire tourner le soft :)
Werner
16 avril 2003, 06h27
Bah en fait nous on décrypte pas le genome humain :)
Le but de Genome@home est de dessiner de nouveaux gènes pouvant coder des protéines opérationnelles au sein de la cellule. Genome@home utilise un algorithme informatique (SPA), basé sur les règles physiques et biochimiques qui gouvernent les gènes et les protéines, afin de dessiner de nouvelles protéines (et à partir de là de nouveaux gènes), n'ayant pas été trouvés dans la nature. En comparant ces "génomes virtuels" à ceux trouvés dans la nature, nous sommes en mesure de bien mieux comprendre comment les génomes naturels ont évolué et comment fonctionnent les gènes et les protéines naturels. Parmi les applications importantes de la base de données de protéines virtuelles :
- fabriquer de nouvelles protéines pour la médecine
- concevoir de nouveaux médicaments
- assigner une fonction aux douzaines de nouveaux gènes séquencés chaque jour
- comprendre l'évolution des protéines
enzo19
16 avril 2003, 19h23
Donc on est pas près de s'arrêter !
En fait, je me suis également posé la même question que Blax' alors que je vous ai lancé dans le projet :D
chalouf
17 avril 2003, 00h49
Bon c'est cool tout sa mais moi je n'arrive toujours pas a l'installer!
:(
streets
17 avril 2003, 08h21
suffit de lancer l'exe et de rentrer les parametres pourtant :D
L'alliance francophone grandit de jour en jour , ce srait bien d'avoir des nouveau membre chez nous aussi ;)
Werner
17 avril 2003, 09h02
On fera une news le 1er mai car en ce moment avec les deux clients et peut-être le nouveau que l'on attend avec impatience c'est un peu gallère à expliquer :)
nonoghost
17 avril 2003, 10h13
Provient du message de Formatman
On fera une news le 1er mai car en ce moment avec les deux clients et peut-être le nouveau que l'on attend avec impatience c'est un peu gallère à expliquer :)
C lequel qu'on attend avec impatience ????
Moi j'etais bien evec mon G@H... j'attends plus rien avec impatience. :smoke:
Werner
17 avril 2003, 10h44
Un vrai client qui fusionne les deux projets et surtout avec un -nonet...
chalouf
17 avril 2003, 11h20
Streets j'ai dejà expliqué mon problème !
Spycam
17 avril 2003, 16h31
A koi correspond les membres inactifs dans les stats de gingko ?
Je viens de m'apercevoir que j'y suis !!!!
Pourtant je genome souvent !
Werner
17 avril 2003, 16h58
Bizarre c'est peut-être parce que tu utilises le nouveau client enfin celui qui fait F@H et G@H ou c'est tout simplement un bug dans ses stats :)
Spycam
17 avril 2003, 17h03
çà doit être un bug : j'utilise le client Genome 0.99
Spycam
19 avril 2003, 13h33
Pour le tableau "Récapitulatif de la puissance de calcul" sur la première page, spycam100 c'est moi : j'ai un athlonXP 1500 +.
Donc çà fait 1.33 Ghz de plus pour la team ! :rambo:
matt-fly
19 avril 2003, 15h14
je remettrai les box a genomiser dans quelques temps, le temps de finir differents travaillent, dans 2 semaines je pense :)
Werner
19 avril 2003, 16h29
Merci pour cette précision Spycam :)
Blax' -> OK pas de soucis
formatman : tu pourras rajouter une nouvelle machine à mon crédit.
Un P4 2.4Ghz qui vient s'ajouter à mon P4 1.9Ghz -> 4.3Ghz pour ma part
Et un celeron 667 pour moi :) il tournera seulement 2 ou 3 heures par jour mais bon tant qu'à l'allumer autant qu'il génomise nan ? :p
Werner
20 avril 2003, 11h15
Merci les gars on avait bien besoin de ça vu le temps que ça met pour calculer avec le client 3.24 :)
bastien
22 avril 2003, 20h04
voila ! je suis de l'équipe !
highlander
22 avril 2003, 21h56
A ce que je voit la famille s'agrandit
Nouveau CPU, nouveau génomisateur et bientôt la barre des 100,du classement mondial va être atteint !! :p
Et puis j'aimerai savoir pourquoi, il y a 11 membres inactifs !! :eek:
Allez !! Je veux des explications et plus vite que ça !! :D :p :D
Non!! Mais c'est quoi ce travail, on abandonne pas son poste comme ça !! :D :p :D
Moi si tout va bien dans 2 semaine je rajoute un p4 1.8 Ghz :p
Werner
28 avril 2003, 07h27
J'ai passé le cap des 30 000 WU ce week-end et plus exactement 30 656 en 81 jours :) Dommage que Blax a arrêté, car il n'aurait pas tardé à atteindre cette barrière :( Bon aller les inactifs on se motive un peu :p
N'oubliez pas de basculez vos client et d'envoyer vos derniers -nonet car la date fatidique arrive :)
PS : on recrutera debut mai :)
enzo19
28 avril 2003, 15h57
Provient du message de Formatman
J'ai passé le cap des 30 000 WU ce week-end et plus exactement 30 656 en 81 jours :) Dommage que Blax a arrêté, car il n'aurait pas tardé à atteindre cette barrière :( Bon aller les inactifs on se motive un peu :p
N'oubliez pas de basculez vos client et d'envoyer vos derniers -nonet car la date fatidique arrive :)
PS : on recrutera debut mai :)
G a peut près 50 000 pions... j'aimerais tout mettre ici mais je vois pas comment faire... une ID formatman ?
Werner
28 avril 2003, 16h28
Si tu veux basculer tous tes points il faut envoyer un mail à stanford. Je sais que Boulnoir des Décodeurs Fous à fais ça dernièrement car c'était écrit sur leur site.
rog62
28 avril 2003, 18h43
Provient du message de Formatman
...PS : on recrutera debut mai :)
On verra si tu seras suffisamment convainquant… ;) :)
Werner
28 avril 2003, 18h52
au pire je sortirai l'artillerie lourde :D De toute façon elle va sortir, mais je ne sais pas trop ce que ça va donner sur du genome... Je ferai une news que quand nous aurons plus d'infos sur ce qu'il va se passer entre le 1 et le 5 mai (tout le monde devra être avec le client Folding d'ici là).
rog62
28 avril 2003, 19h03
Provient du message de Formatman
au pire je sortirai l'artillerie lourde :D...
Lol... :p :p
Provient du message de Formatman
... Je ferai une news que quand nous aurons plus d'infos sur ce qu'il va se passer entre le 1 et le 5 mai (tout le monde devra être avec le client Folding d'ici là).
J'attends avec impatience cette news ;)
Werner
29 avril 2003, 16h47
Lol... :p :p
je pense que 4 Xeon à 3.06GHz ça fera l'affaire :p
Ils sont arrivé aujourd'hui et je dois les torturer 1 mois voir plus avant de les mettres en production donc c'est toujours bon à prendre pour nous 12 GHz :) à partir de demain promis ça genomisera :D
Cougar
29 avril 2003, 17h29
tu en met qquns à mon nom ? :)
Werner
29 avril 2003, 17h42
oui pourquoi pas, mais on avait dit que c'était un secret :p
Cougar
29 avril 2003, 18h26
qu'est ce qui est secret ? ( fait semblant ils ont pas compris) ;)
highlander
29 avril 2003, 23h31
Provient du message de Cougar
qu'est ce qui est secret ? ( fait semblant ils ont pas compris) ;)
Hein de quoi, qu'est-ce qu'on a pas compris ??? :D :p
Spycam
30 avril 2003, 12h19
Provient du message de highlander
Hein de quoi, qu'est-ce qu'on a pas compris ??? :D :p :p :p
Plus qu'un jour avant la date fatidique...
Patience, patience... :sleep:
highlander
3 mai 2003, 04h00
Yes!! ça y est les gars on est dans le top 100 :p :D :p
Pourvu qu'on y reste !! :p :D :p
bah bien sûr qu'on va y rester ... et faut même qu'on continue à monter ;-)
ouais ben j'ai installé la nouvelle version du client, je préfairai 1000 fois l'ancienne ;)
La version console je comprends pas ce qu'elle fait, elle download à chaque fois FAH_Core_XX.exe sans y parvenir, elle me fait les séquences n'importe comment, du genre elle change de protéine toutes les séquences, sympa...
Donc jsuis passé à la version graphique, ça fait semblant de marcher, mais je sais pas si mes résultats vont être comptabilisé ^^
Moralité : Pourquoi changer un soft qui marchait très bien ;)
nonoghost
4 mai 2003, 11h07
Attention Cougar, car personne ne genomise (a ma connaissance) sur la version graphique....
J'avais demandé a Formatman de creer une equipe pour la version GUI mais apparement personne ne s'en sert... pas meme moi ;)
Moi je te conseille de rester a la version console... et on va voir si on peut la bricoler :)
C'est ton partage de connexion au net qui est foireux Coug :D Si ça peut te consoler j'avais aussi des messages d'erreur dans la version console hier après midi sur un serveur...
Format, tu peux ajouter 266 MHz pour mon compte ;-)
(je sais, c'est petit ... mais c'est toujours ça ...)
highlander
5 mai 2003, 13h50
Depuis un certain temps ça me mets ça et donc je ne peut pas génomiser !! :(
Est-ce que ça fait ça à quelqu'un d'autre ? et qu'est-ce que je doit faire ?
ps: Ca me fait au moins 5 fois de suite et après ça se met en sleeping !!
[03:23:06] + Processing work unit
[03:23:06] Core required: FahCore_ca.exe
[03:23:06] Core found.
[03:23:06] Working on Unit 01 [May 5 03:23:06]
[03:23:06] + Working ...
[03:23:06] Folding@home Protein Design Core Version 2.06 (Feb 25, 2003)
[03:23:06]
[03:23:06] Proj: work/wudata_01
[03:23:06] Finding work files
[03:23:06] sizeof(CORE_PACKET_HDR) = 512
[03:23:06] Checking frame files
[03:23:07] Restarting from checkpointed files.
[03:23:07]
[03:23:07] Protein: SH3ligGH2/pdb1ckb.1.spa
[03:23:07] - Frames Completed: 0, Remaining: 600
[03:23:07] - Dynamic steps required: 120000
[03:23:07]
[03:23:08] Printed current.prm
[03:23:08] Writing local files:
[03:23:08] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite)successful.
[03:23:08] - Writing "work/wudata_01.xyz": (overwrite)successful.
[03:23:08] - Writing "work/wudata_01.prm": (overwrite)successful.
[03:23:09] Starting design engine
[03:23:09] [SPG] project name: work/wudata_01.
[03:23:09] [SPG] 1 0
[03:23:09] [SPG] Initializing protein design engine
[03:23:09] [SPG] seed = 836539
[03:23:09] [SPG] Initialization complete
[03:23:09] [SPG] Writing current.pdb, chainlength = 65
[03:23:09] [SPG] Writing current.xyz
[03:23:09] [SPG] Preprocessing . . .
[03:23:09] [SPG] 65 positions in protein
[03:24:48] [SPG] Preprocessing complete
[03:24:48] Iterations: 0 of 600
[03:24:49] Finished
[03:24:50] [SPG] Native chi angles stored
[03:24:51] [SPG] Rotamers read
[03:24:51] [SPG] Starting genetic algorithm
[03:27:14] [SPG] seed: 836539
[03:27:14] [SPG] Designing protein sequence 1 of 30
[03:27:16] CoreStatus = 63 (99)
[03:27:16] + Error starting core.
[03:27:16] Folding@home will go to sleep for 1 day as there have been 5 consecutive Cores executed which failed to complete a work unit.
[03:27:16] (To wake it up early, quit the application and restart it.)
[03:27:16] If problems persist, please visit our website at http://folding.stanford.edu for help.
[03:27:16] + Sleeping...
J'ai eu bcp de prob de ce genre ce week end et j'ai été obligé de vider les réperoires en laissant uniquement "FAH3Console.exe" et "client.cfg"... Le client est quand même moins stable depuis vendredi et je me tape des proteines de 136 voir même 152 ce qui prend un temps fou !
et j'ai oublié d'ajouter qu'aujourd'hui c'est la grosse catastrophe avec la plupart des clients :
[07:52:14] + Attempting to send results
[07:52:16] - Couldn't send HTTP request to server
[07:52:16] + Could not connect to Work Server (results)
[07:52:16] - Error: Could not transmit unit 02 (completed May 5). Keeping unit in queue.
[07:52:16] + Attempting to send results
[07:52:17] - Couldn't send HTTP request to server
[07:52:17] + Could not connect to Work Server (results)
[07:52:17] - Error: Could not transmit unit 02 (completed May 5). Keeping unit in queue.
[07:52:17] + Attempting to get work packet
[07:52:17] - Connecting to assignment server
[07:52:32] + Could not connect to Assignment Server
[07:52:33] - Couldn't send HTTP request to server
[07:52:33] + Could not connect to Assignment Server 2
[07:52:33] + Couldn't get work instructions.
[07:52:33] - Error: Getwork #1 failed, and no other work to do. Waiting before retry
[07:52:38] + Attempting to get work packet
[07:52:38] - Connecting to assignment server
[07:52:53] + Could not connect to Assignment Server
[07:52:54] - Successful: assigned to (171.64.122.125).
[07:52:54] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
Impossible d'envoyer certains résultats ce qui fait que j'en ai une bonne dizaine en attente et j'espère que ça ne sera pas perdu :(
je suis de faire une protéine de 180...3h par séquence lol, c'est interminable.
highlander
5 mai 2003, 17h22
J'ai réinstallé F@H et ça à l'air de tourné
C'est vrai que les protéine sont beaucoup plus longue a calculé :(
moi je suis en F@H depuis le début mais la il est souvent "Sleeping" depuis vendredi aussi !
Bizarre !
Pour le temps de calcul, c'est normal je crois il va faloir vous y habituer, moi c'est comme ca depuis le début :)
Alexlesioux
6 mai 2003, 01h04
Mon calcul de génome ne marche plus :( :( :( je ne comprend plus rien je le lance normal et aprés deux trois seconde pouf plus rien il s'éteint comme une merde le programme se ferme tout seul si vous pouviez m'aidez votre aide est la bienvenue... :rolleyes:
Alex il faut changer de programme on en parle depuis quelques semaines déjà :D
http://www.newdimension-fr.net/showthread.php?s=&threadid=1219&perpage=15&display=&pagenumber=1
C'est parti pour Folding@home !!! :)
Comment savez vous le nombre de WU de votre protéine ?
Et existe toujours des petits logiciel comme GSpy pour Folding ?
Alexlesioux
7 mai 2003, 01h26
Provient du message de Formatman
Alex il faut changer de programme on en parle depuis quelques semaines déjà :D
Je suis complétement ailleurs en ce moment merci... :rolleyes:
streets
13 mai 2003, 18h13
Provient du message de streets
bienvenu Stan, tu le saura je crois une foit un genome de crée
c a dire apres les 30 sequances de calculées et le resutat envoyé.
Sinon prochainement 2 PC vont po tourner pendant 3 semaines
pour cause de vacances forcées :D
Voila ,retour de vacance in Poland en passant par l'Allemagne (2jours passé la bas) , 3 semaines ca fait du bien. . . :cool:
Les 2 pc de chez moi vont pouvoir regenomisé et je vais povoir me remetre a renewser . . .
Ah c'est une bonne nouvelle :)
streets
13 mai 2003, 21h55
tien g viens de voir ke NDFR fait du f@h aussi . . . c koi la config recomandé pour ca . . . si je me rappel bien ca met plus de tps que du g@h
Le numéro de l'équipe :
Saisissez 704901201 pour NewdimensionFR (Gen@Home)
ou
Saisissez 31922 pour NewdimensionFR (Folding@Home)
bah le f@h y a que nortonghost qui en fait :)
sinon le reste c''est du g@h
streets
13 mai 2003, 22h12
yep je viens de voir , il doit se sentir tous seul alors si je pouvais l'aider . . . :D
Provient du message de streets
tien g viens de voir ke NDFR fait du f@h aussi . . . c koi la config recomandé pour ca . . . si je me rappel bien ca met plus de tps que du g@h
Je viens de tester justement un client G@H + un client F@H en même temps sur un PIV 3.06 GHz... seulement 19.7 points en + de 24 heures. C'est comme qui dirait très long :D
C'est bientôt le week end ils nous font encore un petit coup de :
Error: Could not transmit unit 07 (completed May 16). Keeping unit in queue.
:angry:
highlander
16 mai 2003, 13h21
J'ai vu ici (http://www.stanford.edu/~pande/5.19.03/5.19.03.html) Qu'ils allaient changer le core du programme le 19/05/03
Il nous on fait une B.A. à la Matrix :D
streets
16 mai 2003, 20h22
ba je vais le voir demain - Matrix 2 :banana:
donc apparament il y'aura un new programme dés Lundi :cool:
La page à été modif ;)
http://www.stanford.edu/group/pandegroup/folding/reloaded/
y en a qui se prennent pas pour de la merde ;)
Et les versions betas pas très dur à trouver ;)
http://www.stanford.edu/group/pandegroup/release/beta/
3.24-->3.25, ça sent pas la révolution lol :)
Pour l'instant ça change pas grand chose lol vu que nous les genomiens ont a tjrs le même core (de rêve;)) :)
streets
20 mai 2003, 12h32
tiens y'a plus de date d'un coup ;)
y marche po le lien (http://folding.stanford.edu/reloaded/) sur le flash en plus :D
Pour info, depuis le 1er octobre 2000, 100 000 personnes ont participé à Folding@home.
http://folding.stanford.edu/maps/world2.png
( Je sais c'est marqué sur la page principale de leur site mais c'est toujours intéressant à savoir quand on a pas le temps d'y aller ;) )
Et aujourd'hui nous avons dépassé les 100 000 unités (100634.67 pour être plus précis) soit 3909 gênes créés :)
highlander
21 mai 2003, 23h35
Et en nombre d'unité par jour nous sommes 10 ieme
C'est pas mal quand même :)
enfin comme tout ceux qui ont installé le nouveau client ont pas pensé à selectioné "gah", ils font que du calculs folding@home qui est pas pris en compte dans les stats genomes ;)
streets
22 mai 2003, 23h32
ba ca m'etonne Cougar , il n'y a que 2 resustat pour le folding
celui de Format et nonoghost.
je dis pas notre team, mais toutes les autres, quand tu regardes les stats, tu t'apercoit que y a plus que 300 teams qui fournissent des résultats pour le génome.
A chaque fois que folding se ferme de travers ( ce qui arrive fréquement ), çà m'affiche çà et çà bouge plus !!! :
[16:03:05] - Ask before connecting: No
[16:03:05] - Use IE connection settings: Yes
[16:03:05] - User name: Spycam100 (Team 704901201)
[16:03:05] - User ID = 21918BC47E90080C
[16:03:05] - Machine ID: 1
[16:03:05]
[16:03:05] Loaded queue successfully.
[16:03:05] + Benchmarking ...
[16:03:07]
[16:03:07] + Processing work unit
[16:03:07] Core required: FahCore_65.exe
[16:03:07] Core found.
[16:03:07] Working on Unit 01 [May 23 16:03:07]
[16:03:07] + Working ...
[16:03:08] Folding@Home Client Core Version 2.47 (June 14, 2002)
[16:03:08]
[16:03:08] Proj: work/wudata_01
[16:03:08] Done: 23189 -> 142971 (decompressed 616.5 percent)
[16:03:08] nsteps: 5000000 dt: 2.000000 dt_dump: 250.000000 temperature: 298.000
000
[16:03:08] xyzfile:
[16:03:08] " 393 p638_L939_K12M_ext
[16:03:08] 1 N 5.057705 1.783549 2.441836 20..."
[16:03:08] keyfile:
[16:03:08] "parameters ./proj638.prm
[16:03:08] NOVERSION
[16:03:08] ARCHIVE
[16:03:08]
[16:03:08] cutoff 16.0
[16:03:08] taper 12...."
[16:03:08]
[16:03:08] - Couldn't get size info for dyn file: work/wudata_01.dyn
[16:03:08] Starting from initial work packet
[16:03:08]
[16:03:08] Protein: p638_L939_K12M_ext
[16:03:08] - Run: 150 (Clone 77, Gen 0)
[16:03:08] - Frames Completed: 0, Remaining: 400
[16:03:08] - Dynamic steps required: 5000000
[16:03:08]
[16:03:08] Writing local files:
[16:03:08]
[16:03:08] parameters work/wudata_01.prm
[16:03:08] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite) successful.
[16:03:08] - Writing "work/wudata_01.xyz": (overwrite) successful.
[16:03:09] - Writing "work/wudata_01.prm": (overwrite) successful.
[16:03:09] - Writing "work/wudata_01.key": (append) successful.
[16:03:09]
[16:03:09] PROJECT="work/wudata_01", NSTEPS=5000000, DT=2.0000, DTDUMP=25.000000
, TEMP=298.00
[16:03:10] TINKER: Software Tools for Molecular Design
[16:03:10] Version 3.8 October 2000
[16:03:10] Copyright (c) Jay William Ponder 1990-2000
[16:03:10] portions Copyright (c) Michael Shirts 2001
[16:03:10] portions Copyright (c) Vijay S Pande 2001
Je suis ensuite obligé d'effacer le core, pour qu'il refonctionne...
Je reste calme mais si çà continue le PC va faire un vol !!! :p
Une solution docteur Formatman ? ;)
Je ne vois pas mais en tout cas il te télécharge le core folding et vu le numéro d'équipe qui est rentré tes points vont dans l'équipe "poubelle" :D
Pourquoi ? Lequel faut entrer ? :o
( :confused: )
704901201 pour NewdimensionFR (Gen@Home)
ou
31922 pour NewdimensionFR (Folding@Home)
:)
Comment faire pour kil télécharge le core genome ? ( je ne ve pas faire du folding ya presque personne ki en fait ! ). :bandit:
nonoghost
23 mai 2003, 23h21
Laisse tomber, je viens juste de m'y remettre etant donné le bordel que c'est :angry: je sais pas si je vais le garder longtemps....
On va voir si mes stats grimpent...
Provient du message de Spycam
Comment faire pour kil télécharge le core genome ? ( je ne ve pas faire du folding ya presque personne ki en fait ! ). :bandit:
quand tu lances pour la preières fois FAHConsole.exe tu remplies les informations...puis quand il te demande de configurer les "advanced option" tu met yes, et là tu mettras gah quand t'auras le choix entre gah/fah/nopref.
et là tu feras exclusivement du genome ;)
Merci. :)
J'ai fait ce que tu as dit :
[10:22:03] Configuring Folding@home...
User name [Anonymous]? Spycam100
Team Number[0]? 704901201
Ask before fetching/sending work [no] (yes/no)? no
Use Internet Explorer Settings [no] (yes/no)? yes
Change advanced options [no] (yes/no)? yes
Core Type [no-pref] (no-pref/fah/gah)? gah
Core Priority [idle] (idle/low)? idle
CPU usage requested (5-100)? 80
Disable highly optimized assembly code [no] (no/yes)? no
Ignore deadline information (mainly useful if
system clock frequently has errors)? [no] (no/yes)? no
Machine ID (1-4) [1]? 1
[10:23:28] - Ask before connecting: No
[10:23:28] - Use IE connection settings: Yes
[10:23:28] - User name: Spycam100 (Team 704901201)
[10:23:28] - User ID = 21918BC47E90080C
[10:23:28] - Machine ID: 1
[10:23:28]
[10:23:28] Work directory not found. Creating...
[10:23:28] Could not open work queue, generating new queue...
[10:23:28] + Benchmarking ...
[10:23:30] + Attempting to get work packet
[10:23:30] - Connecting to assignment server
[10:23:35] - Successful: assigned to (171.64.122.125).
[10:23:35] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[10:23:36] Loaded queue successfully.
[10:23:37] - Deadline time not received.
[10:23:40] + Closed connections
[10:23:40]
[10:23:40] + Processing work unit
[10:23:40] Core required: FahCore_ca.exe
[10:23:40] Core not found.
[10:23:40] - Core is not present or corrupted.
[10:23:40] - Attempting to download new core...
[10:23:40] + Downloading new core: FahCore_ca.exe
[10:23:44] + 10240 bytes downloaded
[10:23:44] + 20480 bytes downloaded
[10:23:44] + 30720 bytes downloaded
[10:23:44] + 40960 bytes downloaded
[10:23:44] + 51200 bytes downloaded
[10:23:44] + 61440 bytes downloaded
[10:23:44] + 71680 bytes downloaded
[10:23:44] + 81920 bytes downloaded
[10:23:44] + 92160 bytes downloaded
[10:23:44] + 102400 bytes downloaded
[10:23:44] + 112640 bytes downloaded
[10:23:44] + 122880 bytes downloaded
[10:23:44] + 133120 bytes downloaded
[10:23:44] + 143360 bytes downloaded
[10:23:44] + 153600 bytes downloaded
[10:23:44] + 163840 bytes downloaded
[10:23:44] + 174080 bytes downloaded
[10:23:44] + 184320 bytes downloaded
[10:23:44] + 194560 bytes downloaded
[10:23:44] + 204800 bytes downloaded
[10:23:44] + 215040 bytes downloaded
[10:23:44] + 225280 bytes downloaded
[10:23:44] + 235520 bytes downloaded
[10:23:44] + 245760 bytes downloaded
[10:23:44] + 256000 bytes downloaded
[10:23:44] + 266240 bytes downloaded
[10:23:44] + 276480 bytes downloaded
[10:23:44] + 286720 bytes downloaded
[10:23:44] + 296960 bytes downloaded
[10:23:44] + 307200 bytes downloaded
[10:23:44] + 317440 bytes downloaded
[10:23:44] + 327680 bytes downloaded
[10:23:44] + 337920 bytes downloaded
[10:23:44] + 348160 bytes downloaded
[10:23:44] + 358400 bytes downloaded
[10:23:44] + 368640 bytes downloaded
[10:23:44] + 378880 bytes downloaded
[10:23:44] + 389120 bytes downloaded
[10:23:44] + 399360 bytes downloaded
[10:23:44] + 409600 bytes downloaded
[10:23:44] + 419840 bytes downloaded
[10:23:44] + 430080 bytes downloaded
[10:23:44] + 440320 bytes downloaded
[10:23:44] + 450560 bytes downloaded
[10:23:44] + 460800 bytes downloaded
[10:23:44] + 471040 bytes downloaded
[10:23:44] + 480026 bytes downloaded
[10:23:44] Verifying core Core_ca.fah...
[10:23:44] Signature is VALID
[10:23:44] Created: Wednesday April 10, 2002 00:01:22 UTC
[10:23:44] Signed: Monday March 3, 2003 00:18:15 UTC
[10:23:44]
[10:23:44] Trying to unzip core FahCore_ca.exe
[10:23:45] Decompressed FahCore_ca.exe (1466368 bytes) successfully
[10:23:45] + Core successfully engaged
[10:23:50]
[10:23:50] + Processing work unit
[10:23:50] Core required: FahCore_ca.exe
[10:23:50] Core found.
[10:23:50] Working on Unit 01 [May 24 10:23:50]
[10:23:50] + Working ...
[10:23:50] Folding@home Protein Design Core Version 2.06 (Feb 25, 2003)
[10:23:50]
[10:23:50] Proj: work/wudata_01
[10:23:50] Finding work files
[10:23:50] sizeof(CORE_PACKET_HDR) = 512
[10:23:50] Checking frame files
[10:23:50] - Couldn't open work/wudata_01.chk
[10:23:50] Starting from initial work packet
[10:23:50]
[10:23:50] Updating shared core-client information
[10:23:50] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite)successful.
[10:23:50] Key file to update shared file: work/wudata_01.key
[10:23:50] keyfile: 0 68 200 15 2 1 0
[10:23:50] Protein: SH3ligGH2/pdb1abo.1.spa
[10:23:50] - Frames Completed: 0, Remaining: 600
[10:23:50] - Dynamic steps required: 120000
[10:23:50]
[10:23:51] Printed current.prm
[10:23:51] Writing local files:
[10:23:51] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite)successful.
[10:23:51] - Writing "work/wudata_01.xyz": (overwrite)successful.
[10:23:51] - Writing "work/wudata_01.prm": (overwrite)successful.
[10:23:52] Starting design engine
[10:23:52] [SPG] project name: work/wudata_01.
[10:23:52] [SPG] 1 0
[10:23:52] [SPG] Unrecognized atom
[10:23:52] [SPG] Unrecognized atom
[10:23:52] [SPG] Initializing protein design engine
[10:23:52] [SPG] seed = 0
[10:23:52] [SPG] Initialization complete
[10:23:52] [SPG] Writing current.pdb, chainlength = 68
[10:23:52] [SPG] Writing current.xyz
[10:23:52] [SPG] Preprocessing . . .
[10:23:52] [SPG] 68 positions in protein
[10:24:50] [SPG] Preprocessing complete
[10:25:00] Iterations: 0 of 600
[10:25:00] Finished
[10:25:00] [SPG] Native chi angles stored
[10:25:00] [SPG] Rotamers read
[10:25:00] [SPG] Unrecognized atom
[10:25:00] [SPG] Unrecognized atom
[10:25:00] [SPG] Starting genetic algorithm
J'espère que çà marchera.
Je sait pas pourquoi mais j'ai l'impression que c'est le core folding qu'il a téléchargé ! "Folding@home Protein Design Core Version 2.06 (Feb 25, 2003)". :confused:
Je me trompe ?
c'est normal :)
normalement c'est bon .
BeClaude
25 mai 2003, 00h23
Salut à tous,
Je vous signale l'arrivé d'un ami qui ce met dans l'équipe ;)
DelfinO XP2000+ = 1.667GHz
Merci DelfinO et bienvenue dans l'équipe :)
DelfinO
25 mai 2003, 00h42
Yo c moi DelfinO :)
highlander
25 mai 2003, 02h12
Bienvenue chez les Génomisateur DelfinO :)
Bienvenue dans l'équipe DelfinO :)
BeClaude
25 mai 2003, 17h58
Salut à tous,
Et mialin c'est mon frero avec un celeron 1 000 Mhz OV a 1300 Mhz :)
Pour ma part j'ai pas compris mon dernier resultat est pas encore pris en compte j'ai refait la config du client j'espere que je ne fesait pas du Folding ???!!!!!!!!!!
Le frero est ajouté dans la liste ;)
Une nouvelle recrue pour moi, un petit Duron 1.2 Ghz en plus ce qui me fait un total de 4.867 normalement :)
Allez au boulot tout le monde :D
DelfinO
27 mai 2003, 18h12
Euh, je n'ai pas tout suivi, au début, il calcule pour genome@home mais maintenant, il calcule folding@home je crois..... ? pourtant je n'ai pas touché ce progs depuis le début non stop. (genre il calcule 120 000 / 500 000)
Ton client.cfg se présente comme ça (à ouvrir avec le bloc note) :
[settings]
username=NDFRCougar
team=704901201
asknet=no
machineid=1
local=49
[http]
active=no
host=localhost
port=8080
usereg=yes
usepasswd=yes
[clienttype]
type=2
[core]
priority=96
cpuusage=100
disableassembly=no
ignoredeadlines=no
vérifie que t'es bien 2 en face de type.
si c'est pas le cas, met le :)
DelfinO
27 mai 2003, 18h52
oulà, c tout completement différents :
[settings]
username=DelfinO
team=704901201
asknet=no
machineid=1
local=8
[http]
active=no
host=localhost
port=8080
usereg=no
DelfinO
27 mai 2003, 18h57
Je vous montre mes historiques :
Voici le derniere changement automatique genome vers folding....
[22:39:27] [SPG] Writing current.xyz
[22:39:27] [SPG] Sequence 30 completed:
[22:39:27] NLVAIWPYQAPTSNTLGYPSGFIMVPLNPNVGPYLYTWDPATGTKGAVPW . . .
[22:39:27] Iterations: 600 of 600
[22:39:28] Finished
[22:39:29] [SPG] Design complete
[22:39:29] [SPG] completed successfully
[22:39:29]
[22:39:29] Finished Work Unit
[22:39:29] work_hdr.len_arcfile: 112200
[22:39:30] Leaving Run
[22:39:32] - Writing 112712 bytes of core data to disk.
[22:39:32] end (WriteWorkResults)
[22:39:32] - Shutting down core
[22:39:32]
[22:39:32] Folding@Home2 Protein Design Core Shutdown: FINISHED_UNIT
[22:39:32] Left some temporary files
[22:39:35] CoreStatus = 64 (100)
[22:39:35] Sending work to server
[22:39:35] + Attempting to send results
[22:39:44] + Results successfully sent
[22:39:44] Thank you for your contribution to Folding@home.
[22:39:44] + Number of Units Completed: 7
[22:39:48] + Attempting to get work packet
[22:39:48] - Connecting to assignment server
[22:39:49] - Successful: assigned to (171.64.122.144).
[22:39:49] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[22:39:49] Loaded queue successfully.
[22:40:02] + Closed connections
[22:40:02]
[22:40:02] + Processing work unit
[22:40:02] Core required: FahCore_78.exe
[22:40:02] Core not found.
[22:40:02] - Core is not present or corrupted.
[22:40:02] - Attempting to download new core...
[22:40:02] + Downloading new core: FahCore_78.exe
[22:40:04] + 10240 bytes downloaded
... downloading
[22:40:16] + 603591 bytes downloaded
[22:40:16] Verifying core Core_78.fah...
[22:40:16] Signature is VALID
[22:40:16] Created: Wednesday April 10, 2002 00:01:22 UTC
[22:40:16] Signed: Thursday April 3, 2003 00:01:22 UTC
[22:40:16]
[22:40:16] Trying to unzip core FahCore_78.exe
[22:40:16] Decompressed FahCore_78.exe (1728512 bytes) successfully
[22:40:16] + Core successfully engaged
[22:40:21]
[22:40:21] + Processing work unit
[22:40:21] Core required: FahCore_78.exe
[22:40:21] Core found.
[22:40:21] Working on Unit 08 [May 26 22:40:21]
[22:40:21] + Working ...
[22:40:21]
[22:40:21] *------------------------------*
[22:40:21] Folding@home Gromacs Core
[22:40:21] Version 1.48 (May 7, 2003)
[22:40:21]
[22:40:21] Preparing to commence simulation
[22:40:21] - Looking at optimizations...
[22:40:21] - Created dyn
[22:40:21] - Files status OK
[22:40:22] - Expanded 510614 -> 2524929 (decompressed 494.4 percent)
[22:40:22] - Starting from initial work packet
[22:40:22]
[22:40:22] Project: 909 (Run 41, Clone 86, Gen 1)
[22:40:22]
[22:40:22] Assembly optimizations on if available.
[22:40:22] Entering M.D.
[22:40:28] Protein: p909_vill_str0
[22:40:28]
[22:40:28] Writing local files
[22:40:30] Extra 3DNow boost OK.
[22:40:32] Writing local files
[22:40:32] Completed 0 out of 250000 steps (0)
[22:48:32] Writing local files
[22:48:32] Completed 2500 out of 250000 steps (1)
Voilà qu'en pensez vous ?
bah tu peux mettre tout comme moi (sauf l'username bien sur)
"Quand tu lances pour la preières fois FAHConsole.exe tu remplies les informations...puis quand il te demande de configurer les "advanced option" tu met yes, et là tu mettras gah quand t'auras le choix entre gah/fah/nopref. "
Ou tu peux modifier dès maintenant le client.cfg à la main, au ipre si ça marche toujours pas du supprimes tous les fichiers sauf fahconsole.exe :)
jvais ptet faire un prog permettant de corriger ça, histoire de m'occuper un peu ;)
DelfinO
27 mai 2003, 19h07
D'accord mais pourquoi il change le programme genome en folding tout seul....
t'as regardé, c bien çà folding@home alors ? si oui je vais fermer et relancer.
bah pasque pendant l'installation, t'as pas spécifié les "advenced options", du coups le programme fait soit du genome, soit du folding, si par contre tu précises fah (type=2) il ne fera QUE du genome :)
D'après tes logs tu faisais du folding :)
streets
7 février 2004, 23h06
Ba ca fait longtemps qui'il est down ce topic
Alors up avec la version 4 de Folding@Home qui est sortit je ne sais quand d'ailleur . . . :rolleyes:
Allez voir par ici si ca vous dit (http://folding.stanford.edu/download.html) :D
childerik
7 février 2004, 23h41
Streets, tu tiens tant que çà de battre le record ? http://childerikk.free.fr/smilies/ripeer.gif.
Matt
8 février 2004, 01h09
Il est loin du record là ;)
streets
9 février 2004, 12h44
Il est loin du record là ;)ba petit a petit avec un PC qui tourne je vais p-e depasser formatman :p
Werner
9 février 2004, 14h18
Ne me provoque pas Streets :p
streets
9 février 2004, 18h29
Ne me provoque pas Streets :p
si si :p et les autres aussi ;)
Cougar
19 avril 2004, 14h43
Je viens de réinstaller la V4.0 en la voyant sur clubic ;)
je rappelle le num de la team 31922 (http://folding.stanford.edu/cgi-bin/teampage?q=31922)
si y a d'autres amateurs ;) (uniquement folding@home)
Werner
19 avril 2004, 19h33
Je viens de l'installer aussi et je constate une nouvelle fois qu'il faut lancer autant de progr qu'on a de CPU j'ai donc arrêté... le jour où ils feront un vrai programme multi CPU je me laisserai tenter ;)
Cougar
19 avril 2004, 19h59
Lance juste un cpu alors :)
Formatman on t'aiiiiiiiiime
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